L’església de Sant Pere de Premià de Dalt actual data del segle XVI. Es creu que el seu origen és molt més antic. Probablement, aquest temple va ser construït sobre un altre de romànic de la Vil·la Primiliana (nom del Premià de Dalt actual als segles IX i X). Segons documents, a l’any 965 es parla ja d’una església dedicada a Sant Pere (al marc de pedra d’una de les finestres de la façana lateral de la rectoria hi ha una inscripció en una de les pedres, gravada l’any 961).
Anteriorment a la forma gòtica, es pot pensar en una primera construcció romànica, ja que se’n parla al segle X.
Durant la Guerra Civil de l’any 1936, va ser incendiada i assaltada. Es va reconstruir posteriorment l’any 1939.